Il Programma Post-Laurea in Biotecnologie (PPGBIO) è stato implementato nel 1993, con il livello Master, come conseguenza della ricerca svolta presso l'Istituto di Biotecnologia dell'UCS. Nel 2004 il naturale processo di crescita e sviluppo eseguito dalle azioni di insegnamento e ricerca del Master ha reso possibile l'istituzione del Dottorato.
Attraverso le sue due aree di interesse, Biotecnologia Applicata all'Agroindustria e Biotecnologia Applicata alla Salute e all'Ambiente, il Programma ha già laureato 244 master e 76 dottori (dati di marzo 2021). PPGBIO è un programma raccomandato da CAPES, l'istituzione ufficiale di regolamentazione dell'Istruzione Superiore in Brasile. Nella valutazione della classifica 2010 (anni 2007-2009), il Programma ha ricevuto un voto "Molto buono" e un punteggio 5 dal Comitato di valutazione, essendo stato il miglior Programma valutato nell'area delle Biotecnologie. "Il Programma ha mostrato un'evoluzione molto positiva in tutti i requisiti nel periodo di valutazione, con particolare distinzione per la sua produzione intellettuale e tecnologica, raggiungendo elevati standard nell'area. Le prestazioni del programma soddisfano tutti i requisiti per un punteggio 5 nell'area della biotecnologia" - Commenti finali sul comitato di valutazione. Nella valutazione del 2013 (r.f. anni 2010-2012) PPGBIO ha ricevuto nuovamente il punteggio 5.
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